Kompatibilní přístroje
-
Illumina platform: Miseq、Miseq-DX、Nextseq, NovaSeq,
-
Ion torrent: DA8600（Proton), PGM, PGM-DX, S5
-
MGI
Počet testů
16 testů, 32 testů
Certifikace
Typ vzorku
FPE, čerstvá tkáň, pleurální výpotek a ascites, periferní krev
Templát
DNA (cfDNA)+RNA
Technologie
RingCap, PCR amplikon
Detekované geny
-
Hotspot mutace v 50 běžných driverových genech nádorů, včetně bodových mutací (SNV) a malých inzercí a delecí (InDels) 6 fúzí (ROS1, ALK, RET, NTRK1, NTRK2, NTRK3), exon 14 skipping genu MET a amplifikační status genů HER2 a MET.
-
DNA：ABL1、AKT1、ALK、APC、ATM、BRAF、CDH1、CDKN2A、CSF1R、CTNNB1、EGFR、ERBB2、ERBB4、EZH2、FBXW7、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FLT3、GANS、GNA11、GNAQ、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KRAS、MET、MLH1、MPL、NA11、NOTCH1、NPMQ、NRAS、PDGFRA、PIK3CA、PTEN、RB1、RET、SMAD4、SMARCB1、SMO、SRC、STK11、TP53、VHL
-
RNA：ALK、ROS1、RET、NTRK1、NTRK2、NTRK3、MET 14 exon-skipping
-
amplifikace：HER2（ERBB2）、MET
Délka knihovny
250-350bp
Počet amplikonů
213(DNA)+5 RNA internal controls +94（RNA)
Požadovaná kapacita
~2M pair end readů/vzorek DNA
~8M pair end readů/vzorek cfDNA
Sensitivita
DNA: tkáň≥ 1%, cfDNA ≥ 0.5%
RNA: 100 copies/ul
Cell. 2018 Apr 5;173(2):305-320.e10.