top of page

Kompatibilní přístroje
-
Illumina:iSEQ, Miseq, Miseq-DX, Nextseq, NovaSeq
-
MGI: MGISEQ-2000, MGI G99
-
Element Biosciences: AVITI
Počet testů
16 testů, 32 testů
Certifikace

Typ vzorku
Somatické: FFPE, čerstvá tkáň
Zárodečné: periferní krev
Templát
DNA
Technologie
RingCap, PCR amplikon
Detekované geny
-
27 genů a 50 MSI míst
-
POLE exon 9 až 14 (exonukleázová doména)
-
Celá kódující region a exon-intron spojení genů TP53, PTEN.
-
Geny spojené s Lynchovým syndromem: MSH2, PMS2, MLH1, MSH6, EPCAM a další
-
±20bp do intronu
-
Hotspot mutace v genech ARID1A, CCNE1, CTNNB1, ESR1, FBXW7, HER2, KRAS, MECOM, MYC, NRAS, PIK3CA,PIK3R1, POLD1, PPP2R1A, SMARCA4, SMARCB1, SOX17, SPOP,
-
50 microsatelitních sekvencí
-
CNV analýza genů HER2, CCNE1, MECOM, MYC, TERT
Délka knihovny
250-350bp
Počet amplikonů
505
Požadovaná kapacita
~4M pair end readů/ vzorek
Sensitivita
1 %
bottom of page
